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苗栗過港貝化石層是苗栗縣政府的縣定自然紀念物。過港貝化石層為一貝類化石密集層,露頭高約10公尺,寬約20公尺,屬於更新世頭嵙山層。此貝類化石皆屬於淺海相貝類群集,原先沉積於海水深度約20至50公尺處,其中以海扇貝含量最為豐富,後期因為地殼抬升作用,成為苗栗丘陵的一部分。貝化石之出土最早可追溯至日治時期,因為日本人建立縱貫鐵路海線路經此地,進行隧道挖掘工程時意外發現本地地層含有大量貝類化石,包括貝殼、海膽、珊瑚、螃蟹、苔蘚蟲、介形蟲和有孔蟲等,日本官方即立碑標示之,1935年(昭和10年)台灣總督府指定保存。1955年,苗栗縣政府基於本地質環境在地質及古生物研究具有重大意義,重立石碑「過港貝化石層」,並公告為古蹟,依法保存,禁止人為的破壞,不得濫墾,以供學術界研究。來這裡可以順遊過港隧道。

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